基于16S rRNA基因克隆文库技术分析广西富钟水牛瘤胃产甲烷菌组成及多样性

【摘要】：本研究旨在利用16S rRNA基因克隆库技术分析广西富钟水牛瘤胃产甲烷菌组成及多样性。选取3头体况基本一致的健康雌性富钟水牛作为试验动物,采用机械破壁法提取瘤胃内容物总DNA,采用产甲烷菌引物Met86F/Met1340R扩增16S rRNA基因,构建16S rRNA基因克隆文库。结果表明,本试验共获得93个非嵌合体16S rRNA序列,按照97%的相似性划分为39个分类操作单元(OTU)。其中,60个序列(15个OTU)与已培养细菌16S rRNA序列相似性≥97%,占总序列的64.5%;32个序列(23个OTU)与已培养菌16S rRNA序列相似性处于90%~(97%);仅有1个序列与Methanomassiliicoccus luminyensis相似性90%。系统发育树分析表明,98.9%的序列均属于甲烷杆菌目(Methanobacteriales),部分序列与Methanobacteriales中任何已知相似序列都相隔较远,它们可能代表Methanobacteriales中新的属或种。由上述结果可见,富钟水牛瘤胃产甲烷菌以Methanobacteriales为优势菌群,其中有许多未知的产甲烷菌需进一步分离培养并对其功能进行分析。 【作者单位】： 中国农业科学院广西水牛研究所 农业部(广西)水牛遗传繁育重点实验室;
【关键词】： 富钟水牛 瘤胃 产甲烷菌 多样性
【基金】：广西自然基金青年基金项目(2012GXNSFBA053070) 广西水产畜牧兽医局科技计划项目(桂渔牧科1304516) 农业部948项目(2011-G26)
【分类号】：S823
【正文快照】： 广西富钟水牛是我国地方水牛的特色品种之一,2006年被列入《国家级畜禽遗传资源保护名录》[1]。富钟水牛体型较大,具有繁殖力高、成熟早、肉质好、性情温顺、耐粗饲等优良特性[2-3],适合广西壮族自治区东北丘陵地带以低洼水田及黏性土壤旱地的耕作环境条件生长。然而,据2009年

您可以在本站搜索以下学术论文文献来了解更多相关内容

富钟水牛    陈英姿;何衍琦;

国家级畜禽遗传资源保护名录    

瘤胃微生态系统    马松成;陈静;毛华明;

产甲烷菌的分离纯化培养及其培养基对于菌株的选择作用    庞德公;杨红建;

昭平县养牛业现状与发展思路    唐明诗;卢一浪;

PCR-DGGE技术在水牛瘤胃产甲烷菌多样性分析中的应用    刘园园;姜伟伟;秦红玉;张卉;王士长;

PCR技术在黄淮白山羊瘤胃产甲烷菌检测中的应用    华金玲;王立克;杨芝;刘明明;

基于16S rRNA基因序列分析梅花鹿瘤胃细菌多样性    李志鹏;刘晗璐;崔学哲;荆祎;鲍坤;徐超;杨福合;李光玉;

水牛营养研究新进展    杨承剑;杨炳壮;梁辛;梁贤威;

反刍动物瘤胃甲烷生成机制及调控措施研究进展    乔升民;乔君毅;谭支良;

肠道产甲烷菌与肥胖    胡婷姿;王学红;

高脂饮食对SD大鼠排便状况和粪便菌群的影响及其意义    王志凡;马慧;陈旺盛;杨秀琳;

晋南牛和山羊瘤胃产甲烷菌多样性研究    裴彩霞

添加延胡索酸二钠对湖羊瘤胃发酵和菌群结构的影响    周亚文

牦牛瘤胃微生物基因组文库构建与16S rDNA生物多样性研究    安登第

来源于嗜盐古生菌的RM07 DNA片段在三域模式生物中的启动子功能研究    杨洋

极端嗜盐古生菌质粒pHH205全序列测定及功能分析    叶学成

用Real Time PCR和DGGE技术研究放牧藏系绵羊瘤胃微生物季节动态    淡瑞芳

水生植物的瘤胃微生物转化    岳正波

不饱和脂肪酸及莫能菌素对羊瘤胃、血液脂肪酸合成的影响    刘立成

瘤胃产甲烷菌定量检测与微生物菌群调控研究    郭嫣秋

不同季节日粮组成对狍瘤胃微生物区系、瘤胃内环境及血清生化指标的影响    常维毅

苹果酸对瘤胃微生物体外发酵及山羊瘤胃代谢的影响    庞学东

日粮中粗饲料品质对绵羊瘤胃微生物区系和纤维降解影响的研究    薛丰

12株瘤胃细菌的分离及痤疮丙酸杆菌对瘤胃微生物发酵的影响    赵明娟

膨化全脂大豆对瘤胃微生物氢化作用和组织中△9-脱氢酶mRNA表达量的影响    朱成明

椰子油对不同日粮条件下绵羊瘤胃微生物及甲烷产量的影响    黄小丹

不同精粗比下驱除原虫对绵羊瘤胃微生物区系及饲料降解的影响    付琦

Actinomyces Ruminicola的分离及其微生态制剂对瘤胃发酵的影响    胡盼

草食动物厌氧真菌及其共存甲烷菌的分离鉴定和体外发酵特性的初步研究    金巍

不同类型内蒙古白绒山羊瘤胃甲烷菌数量及多样性比较研究    王庆红

转录因子Nrf2对脂多糖诱导Kupffer细胞NF-κB活化的抑制作用及机制研究    张哲

富钟水牛及其在钟山县的养殖前景    陈军;廖胜保;郭世文;

役肉兼用型良种牛——富钟水牛    陈英;

广西沼泽型水牛血清蛋白多态性的研究    邓继贤;杨秀荣;何荆洲;蒋和生;

国家级畜禽遗传资源保护名录(牛)    水木;