共存于厌氧真菌分离培养液中瘤胃甲烷菌的检测及其多样性分析

【摘要】：对分离自山羊瘤胃的真菌分离培养液中甲烷菌进行16SrDNA扩增、DGGE分析、RFLP及测序分析,研究共存于真菌分离培养液中甲烷菌的种类及其多样性。DGGE结果显示:从厌氧真菌分离至第45代,甲烷菌多样性指数由1·32降至0·99,相似性最低为34·7%;第45代至62代,多样性指数由0·99升至1·15,相似性最低为89·2%。RFLP多态性分析69个克隆共得到5个操作分类单元,选择其中6个具有代表性的序列进行测序。序列及系统进化分析表明,属于其中3个操作分类单元的克隆最相似菌都是UnculturedarchaealsymbiontPA202,相似性均为95%,没有与这些克隆相似性较高的已培养甲烷菌;属于另外2个操作分类单元的克隆最相似菌都是Unculturedrumenmethanogen956,相似性均为97%,最相似已知菌为Methanobrevibactersp.NT7,相似性为97%。结果表明,真菌培养液中存在目前尚未分离培养的瘤胃甲烷菌。 【作者单位】： 南京农业大学消化道微生物研究室 南京农业大学消化道微生物研究室 南京农业大学消化道微生物研究室 浙江大学动物科学学院 南京农业大学消化道微生物研究室
【关键词】： 厌氧真菌 甲烷菌 DGGE RFLP
【基金】：国家自然科学基金项目(30530560) IAEA项目(12665/RO)~~
【分类号】：S852.6
【正文快照】： 反刍动物瘤胃内栖息着各种微生物,包括瘤胃细菌、原虫、厌氧真菌和甲烷菌。这些微生物互相作用、互相影响,在瘤胃内形成一个复杂的降解饲料、给宿主动物提供挥发性脂肪酸和微生物蛋白的生物群落。甲烷是瘤胃微生物代谢的终产物之一,它的产生是能量的损失,也是温室气体之一,因

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