甲烷八叠球古菌及其他广古菌同义密码子使用偏好性(英文)

【摘要】：比较分析了甲烷八叠球古菌(Methanosarcina mazei str.Goe1)和其他2种系统发育相关的广古细菌(嗜苦古菌(Picrophilus torridus str.DSM9790)和盐碱古菌(Natronomonas pharaonis str.DSM2160))的同义密码子使用偏好性.结果表明甲烷八叠球古菌的密码子使用偏好性很小,并且与GC3S值有很高的相关性.这3种广古细菌的密码子使用模式在进化上很保守.通过分层聚类分析,得出较之基因功能对密码子使用的影响,这些广古菌密码子的使用更是由其物种所决定的.考虑到这3个物种生活在pH值差异很大的环境中,推测其生活环境在很大程度上决 【作者单位】： 东南大学生物电子学国家重点实验室 东南大学生物电子学国家重点实验室 东南大学生物电子学国家重点实验室 东南大学生物电子学国家重点实验室 东南大学生物电子学国家重点实验室
【关键词】： 密码子使用偏好性 密码子使用相对概率(RSCU) 甲烷八叠球古菌
【分类号】：Q933
【正文快照】： Methanosarcina mazei str.Goe1can be found indecaying leaf litter,garden soil,and other urban waste.Its growth occurs at pH5.5to8.0, with optimumgrowth at pH6.8to7.2.Picrophilus torridus str.DSM9790is a thermoacidophile,and can grow at tempera-tures of ar

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