产甲烷常温菌和嗜热菌代谢网络特征的比较研究

【摘要】：以产甲烷的常温古细菌Methanosarcina acetivorans(MAC)和嗜热古细菌Methanopyrus kandleri(MKA)的代谢网络为研究对象,分析了网络的拓扑结构与功能之间的关联性。本文利用Networkx计算了代谢网络的度、度的中心性、紧密度中心性以及介数中心性等参数值,通过比较分析发现常温古细菌MAC和嗜热古细菌MKA存在氨基酸代谢以及碳水化合物代谢保守途径,且都具有明显更高的度。结果同时表明子途径00010(糖酵解/糖异生)、00020(柠檬酸循环)、00250(丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢)是常温古细菌MAC与嗜热古细菌MKA2个生物体的重要途径。 【作者单位】： 江南大学物联网工程学院;工业生物技术教育部重点实验室;
【关键词】： 代谢网络 古细菌 产甲烷菌
【基金】：国家自然科学基金资助项目(21001053) 中央高校基本科研业务费专项资金资助(JUSRP11126)
【分类号】：Q811.4
【正文快照】： 1引言近年来，利用复杂网络理论来研究真实网络，并通过图论、计算机模拟等方法研究网络的结构特征、网络的生成机制及演化规律等一系列问题，己取得了一些重要成果，其发展为在系统水平上研究生物网络提供了新平台l1J。对代谢网络复杂的拓扑结构的研究，己成为最近几年的热

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